Missions

Le candidat développera des outils théoriques, mathématique de traitement du signal par ondelette et transformée de Fourier, de la classification, ML, DL, théorie du contrôle stochastique puis des modèles de signaux d’électrophysiologie ainsi que des modèles mathématiques pour analyser signaux Voltage dans les astrpocytes et neurones, des réseaux de neurones et des simulations numériques conformes à celles développées par le groupe David Holcman. Nous allons utiliser des mélanges de Deep-Learning, ondelettes pour interpréter des enregistrements physiologiques pouvant aller de la nano-électrode à l’EEG. Une collaboration est en cours avec UCSF, Weizmann Institute, Collège-de-France et plusieurs hôpitaux parisiens.

Activités

Le candidat développera des outils théoriques, mathématique de traitement du signal par ondelette et transformée de Fourier, de la classification, ML, DL, théorie du contrôle stochastique puis des modèles de signaux d’électrophysiologie ainsi que des modèles mathématiques pour analyser signaux Voltage dans les astrpocytes et neurones, des réseaux de neurones et des simulations numériques conformes à celles développées par le groupe David Holcman. Nous allons utiliser des mélanges de Deep-Learning, ondelettes pour interpréter des enregistrements physiologiques pouvant aller de la nano-électrode à l’EEG. Une collaboration est en cours avec UCSF, Weizmann Institute, Collège-de-France et plusieurs hôpitaux parisiens.

Compétences

mathématiques / physique / informatique / EEG neuroscience
simulations / analyse de données / python/matlab/DL
Compétences relationnelles : Interactions avec les partenaires biologiques

Contexte de travail

L’Institut de biologie de l’ENS (IBENS) est un centre de recherche fondamentale qui mène des recherches originales visant à décrypter les mécanismes fondamentaux au cœur des processus biologiques.

Unité mixte ENS-CNRS-INSERM, l’IBENS accueille plus de 300 personnes regroupées en 30 équipes autonomes conduisant une recherche hautement collaborative et multidisciplinaire qui allie approches expérimentales et théoriques.

L’activité de recherche couvre des champs thématiques variés : Neurosciences, Biologie du développement, Génomique fonctionnelle, Écologie et biologie de l’évolution.

Plusieurs plateformes technologiques, notamment en imagerie, génomique, protéomique et bio-informatique sont à la disposition des chercheurs. Les recherches menées à l’IBENS bénéficient des interactions avec d’autres disciplines présentes à l’ENS (physique, chimie, sciences cognitives, mathématiques). L’IBENS est activement impliqué dans la formation des étudiants et jeunes chercheurs à tous les niveaux.

L’équipe d’accueil Mathématiques appliquées et Biologie computationnelle, dirigée par David Holcman comprend une dizaine de d’étudiants et chercheurs tout confondu.
L’objectif de l’équipe est de comprendre et de quantifier les mécanismes sous-jacents de la biologie computationnelle.
Analyse de données, simulations et classification, biologie computationnelle et sciences associées, médecine.

Contraintes et risques

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