Santé publique France est l’agence nationale de santé publique française. Etablissement public de l’Etat sous tutelle du ministre chargé de la santé créé par l’ordonnance 2016-246 du 15 avril 2016, elle intervient au service de la santé des populations. Agence scientifique et d’expertise du champ sanitaire, elle a pour missions :

• L'observation épidémiologique et la surveillance de l'état de santé des populations ;
• La veille sur les risques sanitaires menaçant les populations ;
• La promotion de la santé et la réduction des risques pour la santé ;
• Le développement de la prévention et de l'éducation pour la santé ;
• La préparation et la réponse aux menaces, alertes et crises sanitaires ;
• Le lancement de l'alerte sanitaire.

L’agence est organisée autour de directions scientifiques et transversales et de directions assurant le support et le soutien à l’activité.
Son programme de travail, arrêté par son Conseil d’administration, s’articule autour de cinq axes prioritaires : les déterminants de santé, les populations, les pathologies, les interventions et les territoires, et les infrastructures.

Direction Appui, Traitements et Analyses des données (DATA) - Unité Applications, big data et surveillance syndromique (ABISS)

Missions

La personne recrutée aura pour mission principale de traiter des données issues de systèmes de surveillance épidémiologique. Le traitement des données est à comprendre au sens large du terme, incluant la gestion de bases de données, l’écriture de scripts, leur optimisation, la construction d’indicateurs épidémiologiques (en utilisant des méthodes adaptées statistiques ou de data science) et la restitution de ces indicateurs (bulletins, tableaux de bord). Les données traitées pourront être issues de systèmes de surveillance spécifiques ou non spécifiques.
La personne recrutée aura vocation à travailler sur des thématiques diverses en termes de populations étudiées (population générale, populations spécifiques), pathologies ou déterminants de santé. Un accent pourra être porté, en tant que de besoin, sur le développement et le maintien d’outils et de processus pour être en capacité de produire quotidiennement des indicateurs en réponse à une situation d’alerte et/ou de crise.
La personne recrutée contribuera également au développement et à l’implémentation de méthodes et outils innovants dans le champ du traitement des données de santé.

Activités

Sous l’autorité du responsable d’unité et en lien étroit avec les personnes impliquées dans la surveillance épidémiologique et la direction des systèmes d’information, les activités du chargé d’analyse et d’expertise seront notamment :

• Assurer la gestion, le traitement et la restitution des données :
  • Accompagner le système de gestion des données et des pipelines
  • Organiser et préparer les données
  • Explorer et proposer les moyens technologiques pour améliorer la qualité et la fiabilité des données
  • Identifier les possibilités d'acquisition et d’intégration de nouvelles donnée
  • Construire les indicateurs de surveillance (définition, implémentation, interprétation) en R, Python, Jupyter Notebook
  • Réaliser des analyses statistiques
  • Développer des outils pour la restitution des indicateurs : mise à disposition interne et externe (exports, API), outils de visualisation (applications R-Shiny – Dash - Bokeh) et de reporting (RMarkdown)
  • Rédiger des notes méthodologiques pour décrire les traitements réalisés.
• Intervenir en soutien sur la gestion, le traitement, l’analyse et la restitution de nouvelles bases de données gérées par la DATA, notamment pour la surveillance des pathologies hivernales ou de pathologies émergentes.
• Contribuer à la réflexion sur la modernisation des outils de data engineering / data science pour la préparation, l’exploration, le stockage, l’analyse et la restitution des données, partage de connaissances/animation, notamment au sein du DATA-LAB.
• Contribuer à la valorisation des résultats en lien avec les épidémiologistes et les statisticiens :
  • Communiquer des résultats
  • Rédiger des bulletins, rapports d’études et d’articles scientifiques.

La personne recrutée participera à la continuité d’activité au travers des permanences hebdomadaires et des astreintes de week-end sur le périmètre de ses activités.