À propos de nous

L’université de Caen Normandie (UNICAEN) est un acteur majeur et un moteur de développement de l’enseignement supérieur et de la recherche en Normandie. UNICAEN est membre de la communauté d’universités et d’établissements Normandie Université.

Pluridisciplinaire, elle accueille plus de 33 000 étudiants au sein de 12 composantes (UFR, écoles, instituts ). Elle propose des diplômes reconnus et contrôlés par l’État et transférables dans de nombreux pays européens grâce au système Licence-master-doctorat (LMD).

Afin de mener ces missions, elle s’appuie sur 2 700 professionnels, dont 1 600 personnels enseignants (1 060 enseignant.es-chercheur.ses et 540 enseignant.es) et 1 100 personnels des bibliothèques, ingénieur.es, administratif.ves, techniques, sociaux et de santé (BIATSS).

Mission

Lieu de travail : Laboratoire ABTE, Equipe MALIM - IUT GON Caen - Campus 1
Vous serez amené à travailler ponctuellement sur le campus 2 de l’université de Caen pour travailler au sein de l’équipe ECOTEA du laboratoire ABTE afin d’y réaliser les analyses en chromatographie.
Descriptif du projet:
Les microorganismes font partie intégrante des écosystèmes alimentaires, en particulier ceux des aliments fermentés tels que les fromages au lait cru. Ces derniers représentent une minorité des fromages fabriqués à l’échelle nationale (16%), mais sont considérés comme hautement qualitatifs (4/5 sont sous signe d’Appellation d’Origine Protégée ou d’Indication Géographique Protégée). Ils sont également considérés à forte valeur ajoutée, rémunérateurs et source d’emploi pour les producteurs de lait et les transformateurs. Les communautés microbiennes du lait cru sont riches et complexes. Ces microorganismes contribuent à la qualité organoleptique du produit (ex : richesse aromatique), à une potentielle fonction barrière contre des bactéries pathogènes ou encore à des bénéfices santé pour le consommateur. Néanmoins, le lait cru peut dans certains cas également être source d’agents pathogènes, d’agents d’altération, ou présenter une abondance et une diversité faibles en flore d’intérêt technologique. En effet, différents facteurs peuvent influencer négativement la qualité des laits crus. Nous prenons conscience aujourd’hui de l’impact de la perte croissante de biodiversité d’espèces animales et de plantes sur les écosystèmes. En ce qui concerne les espèces microbiennes, les études portant sur la microbiodiversité restent rares. Dans ce contexte, il est important de se pencher sur les facteurs pouvant négativement influencer la diversité et les potentiels de fonction des microorganismes dans les laits. D’une manière générale, les communautés microbiennes naturelles sont riches d’un point de vue diversité et interactions qui y règnent, leur étude est donc complexe. L’étude du microbiote du lait cru et de ses potentielles fonctions pour les produits transformés lors de sa mise en œuvre représente donc un véritable défi car d’une extraordinaire complexité et variabilité. Afin d’explorer ce monde, la construction de communautés microbiennes synthétiques, ou Syn Coms, représente une approche intéressante. Ces communautés composées de microorganismes conservent en effet les caractéristiques clés des communautés microbiennes naturelles visées et, en raison de leur complexité réduite et de leur nature définie, présentent un intérêt particulier en tant que systèmes modèles d’étude. Dans le domaine de l’écologie microbienne des aliments, la pertinence d’une Syn Com lait cru reste à ce jour inexplorée. Dans le cadre du projet Micro MILC, la faisabilité d’obtention d’un tel outil sera explorée afin de servir de base à de futures études innovantes et ambitieuses en écologie microbienne des aliments.
La mission confiée sera de créer une ou plusieurs Syn Com(s) lait qui soi(en)t représentative(s) de la microflore d’un lait cru riche d’un point de vue diversité microbienne et profil de métabolites secondaires (potentiel fonction).
Les objectifs visés sont :
Caractériser l’abondance, la diversité bactérienne, le potentiel anti-pathogène, et le profil de métabolites secondaires de communautés microbiennes naturelles de laits crus normands.
Assembler des Syn Coms, composées de souches microbiennes représentatives de la diversité et de l’abondance de la microflore naturelle des laits cru, et les maintenir dans des conditions standardisées de culture.
Comparer les profils métaboliques des communautés naturelles à ceux des Syn COMs afin de valider 1 ou plusieurs Syn Com(s) représentative(s) de la microflore du lait cru et pouvant servir de communauté(s) modèle(s) dans de futures études.
Vous travaillerez en collaboration avec Margot Schlusselhuber (Maitre de conférences HDR, Equipe MALIM) et Caroline Amiel (Maitre de conférences HDR, Equipe MALIM). Vous interagirez également avec d’autres scientifiques, microbiologistes et chimistes, du laboratoire ABTE ainsi qu’avec des professionnels de la filière laitière.
Conditions de recrutement:
Recrutement sur contrat de recherche et sous réserve de disponibilité du financement.
Temps complet
Poste ouvert uniquement aux contractuels.
Rémunération statutaire et appréciée en fonction de l’expérience professionnelle
Poste à pourvoir : en janvier 2025, jusqu'en novembre 2026.
Date limite de candidature : Avant le 15 novembre 2024

Profil

Catégorie d'emploi : A - Ingénieur d'études

Diplôme requis :
Titulaire d’un Master 2 en microbiologie, avec une expérience en laboratoire de recherche. Vous avez moins de 3 ans d’expérience en tant qu’ingénieur d’étude. Le (la) candidat(e) doit posséder de solides bases scientifiques en microbiologie, ainsi qu’un esprit créatif et des capacités d’autonomie et relationnelles. Rigueur, et bonnes capacités de communication sont attendues. Vous êtes dynamique, et motivé(e). Vous êtes titulaire du permis de conduire valable en France et vous maitrisez la langue française (indispensable pour la collecte des échantillons de lait cru dans les fermes).
Compétences et connaissances souhaitées :
Techniques classiques de microbiologie
Utilisation de fermenteurs en batch continu
Techniques d’analyses par GC-MS et/ou en LC-HRMS
Analyses métagénétiques